Die Geschäftsstelle der ÖGNI sitzt seit Juni 2011 in Linz (Oberösterreich). Das Team ist die primäre Anlaufstelle für die Aufgabenbereiche der ÖGNI und steht jedem gerne persönlich zur Verfügung.
Unter der Leitung des Gründungspräsidenten stehen die Mitglieder sowie die Stakeholder der Bau- und Immobilienbranche im Mittelpunkt der Kommunikation. ÖGNI Experten und Projekte im Neubau und im Bestand werden von der Geschäftsstelle betreut. In ihren Aufgabenbereich fällt die Betreuung des Zertifizierungsprozesses, von der Anmeldung bis zur Zertifikatsverleihung, sowie die qualitätsprüfende Komformitätsprüfung. Zu den Aufgaben der Geschäftsstelle gehört das Organisieren von Veranstaltungen sowie die Betreuung der Web 2.0 Aktivitäten.